跨國集團為有效降低各地稅務機關對移轉訂價之查核風險，大多建置合理交易訂價模式，惟營利事業實際營運結果可能因市場景氣波動、原物料價格變動、利率及資金成本上升等不可預期因素影響，導致期末實際利潤與原先訂價政策產生差異。台灣自民國109年度起實施一次性移轉訂價調整（以下稱「一次性TP調整」）機制，提供營利事業在特定條件下可追溯調整年度利潤，然而，大多數營利事業，在最終評估相關法令遵循要件的時候，仍無法適用，因此，「何時啟動」、「如何執行」及「達到何種程度始符合規範」，是適用一次性TP調整的重要關鍵。
實務上，營利事業常常於接近年底結帳之際，才發現整體經營結果偏離預期，這時候要開始啟動一次性TP調整，大多來不及因應，以從事關係企業進口交易之曆年制公司為例，在會計年度一開始就需要評估利潤變動因子、未來可能受影響程度、適時開放進口報單；於年度結束後，向海關申請核定進口完稅價格及完成營所稅申報資訊揭露等，一連串的程序準備，不是年底開立一張調整發票就可完成一次性TP調整。此外，針對不同交易型態亦應留意相關申報規範，例如涉及營業稅、貨物稅或跨境勞務服務時，須同步配合辦理相應之申報及扣繳程序。
另一個營利事業常面臨的挑戰是，涉及進口交易時，有多少報關單需要註記申報適用一次性TP調整，實務上，海關進行實地查核若發現刻意將利潤集中於少數報單，導致同樣貨物完稅價格出現落差，係與關稅估價規定不符，進而影響海關審查結果，無法達到一次性TP調整之效益，故實際操作時，建議先參考歷年進貨水準，預估全年交易量、進口報單數及整理利潤影響程度，進行全面性評估，並非針對單一報單或特定賣方進行選擇性調整。
針對一次性TP調整的實施，雖然讓營利事業在移轉訂價風險控管上有明確的法令依循，但完成相關法遵程序，並不代表稅務機關將全然接受調整結果，於後續營所稅案件查核時，稅務機關仍會檢視調整內容是否符合移轉訂價相關法令規定，必要時亦可能要求補充說明或進一步查核。因此，營利事業在執行一次性TP調整前，應事先審慎評估既有移轉訂價政策是否合理，釐清影響交易訂價的關鍵因素，並妥善準備相關佐證資料，綜合評估執行一次性TP調整之效益，以達到落實移轉訂價策略並降低移轉訂價查核補稅之目的。
